Per impostazione predefinita, i contenuti dei messaggi Testo e HTML sono codificati con il meccanismo "quoted-printable". Tutti gli altri allegati sono codificati via base64 se non è stata specificata un'importazione differente con il metodo addAttachment() o con un'assegnazione successiva alla parte MIME dell'oggetto. Le codifiche 7Bit e 8Bit attualmente sono concesse solo per i dati con contenuto binario. Zend_Mail_Transport_Smtp codifica le linee cominciando con uno o due punti così che l'e-mail non vìoli il protocollo SMTP.